Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H2Q13888 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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