Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR3Q13615 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR3Q13615 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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