Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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