Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAMF1Q13291 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms