Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms