Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3FQ13275 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3FQ13275 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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