Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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