Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MRPL28Q13084 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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