Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRN3Q13033 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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