Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF2Q12772 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF2Q12772 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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