Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YAE1YJR067C 426 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PAU18YLL064C 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PAU6YNR076W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 SIL1YOL031C 1266 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 SCP1YOR367W 603 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 PAU24YBR301W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 HSL1YKL101W 4557 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 LCB4YOR171C 1875 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 REC114YMR133W 1287 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 TPS2YDR074W 2691 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 CLB4YLR210W 1383 nt2.46□□□□□ -2.01
TY1B-BRQ12193 CYR1YJL005W 6081 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 TUS1YLR425W 3924 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 STD1YOR047C 1335 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 YPR117WYPR117W 7470 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 PDP3YLR455W 915 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 FOL3YMR113W 1284 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 YOR114WYOR114W 885 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 RPS30BYOR182C 192 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 SKT5YBL061C 2091 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 YDL118WYDL118W 381 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 CDC123YLR215C 1083 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 YOR097CYOR097C 528 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 PHO81YGR233C 3537 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 LSM1YJL124C 519 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 YJR023CYJR023C 402 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 COQ9YLR201C 783 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 CBS2YDR197W 1170 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 SDP1YIL113W 630 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 ACM1YPL267W 630 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 SWD3YBR175W 948 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 RRI1YDL216C 1323 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 PFD1YJL179W 330 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 FES1YBR101C 873 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 GEA2YEL022W 4380 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 IRA1YBR140C 9279 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 SSF1YHR066W 1362 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 SEC65YML105C 822 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 AFT2YPL202C 1251 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 YPR027CYPR027C 834 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 SAD1YFR005C 1347 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 CWC22YGR278W 1734 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 PDR8YLR266C 2106 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 DNF3YMR162C 4971 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 CPR5YDR304C 678 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 CDC73YLR418C 1182 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1B-BRQ12193 MPP6YNR024W 561 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 MEC1YBR136W 7107 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 YPK1YKL126W 2043 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 TRZ1YKR079C 2517 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 HMO1YDR174W 741 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 DAD2YKR083C 402 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 SPO20YMR017W 1194 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 ROM2YLR371W 4071 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 TOR2YKL203C 7425 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 PHR1YOR386W 1698 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 ENV10YLR065C 546 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 DSE3YOR264W 1293 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 FAR11YNL127W 2862 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 ISW1YBR245C 3390 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 OKP1YGR179C 1221 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 AIM23YJL131C 1071 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 YOR146WYOR146W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 YLR419WYLR419W 4308 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 NAN1YPL126W 2691 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 MDM10YAL010C 1482 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 PHO12YHR215W 1404 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 PHO11YAR071W 1404 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 DAD3YBR233W-A 285 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 CFT2YLR115W 2580 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 REC102YLR329W 795 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 ATP11YNL315C 957 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 INA17YPL099C 549 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 UTP21YLR409C 2820 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 CTF13YMR094W 1437 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 RPS1AYLR441C 768 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 YBR090CYBR090C 369 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 SLX9YGR081C 633 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 DID4YKL002W 699 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 TRX1YLR043C 312 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 RRP7YCL031C 894 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-BRQ12193 PGS1YCL004W 1566 nt2.34□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 SWC4YGR002C 1431 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 RPS18AYDR450W 441 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 HUA2YOR284W 732 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 DSN1YIR010W 1731 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 YGL176CYGL176C 1665 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 DAS2YDR020C 699 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 ATG34YOL083W 1239 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 IRE1YHR079C 3348 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 PRP6YBR055C 2700 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 RNY1YPL123C 1305 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 MAK10YEL053C 2202 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 SNF11YDR073W 510 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 COS3YML132W 1140 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 CLU1YMR012W 3834 nt2.31□□□□□ -2.04
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