Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 ENT2YLR206W 1842 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YFL063WYFL063W 456 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 RPA34YJL148W 702 nt5.7□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 SHS1YDL225W 1656 nt5.69□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt5.69□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 AIM26YKL037W 357 nt5.69□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt5.69□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YOR131CYOR131C 657 nt5.69□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 SSZ1YHR064C 1617 nt5.69□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 POL12YBL035C 2118 nt5.69□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 VAC8YEL013W 1737 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 DBF2YGR092W 1719 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 KEX2YNL238W 2445 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 MNN5YJL186W 1761 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 MAL33YBR297W 1407 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 RGI2YIL057C 495 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 PHS1YJL097W 654 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YBR242WYBR242W 717 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 NOT5YPR072W 1683 nt5.68□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 OTU1YFL044C 906 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YGR022CYGR022C 330 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YJL086CYJL086C 369 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 PAM18YLR008C 507 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YOR146WYOR146W 306 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 AIM14YGL160W 1713 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 KKQ8YKL168C 2175 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 STE7YDL159W 1548 nt5.67□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 TUP1YCR084C 2142 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YOR022CYOR022C 2148 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 DSN1YIR010W 1731 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 GRX4YER174C 735 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YKE2YLR200W 345 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 RPL9BYNL067W 576 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 RPS9AYPL081W 594 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 NOC2YOR206W 2133 nt5.66□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YDR133CYDR133C 336 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 MFA1YDR461W 111 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YGL165CYGL165C 579 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 JIP3YLR331C 378 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 TIR2YOR010C 756 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YBR016WYBR016W 387 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 YPR059CYPR059C 387 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 snR48snR48 113 nt5.65□□□□□ -1.5
TFB4Q12004 HRK1YOR267C 2280 nt5.65□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 STE20YHL007C 2820 nt5.65□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 CTM1YHR109W 1758 nt5.65□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 SWP82YFL049W 1872 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 DSL1YNL258C 2265 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 UBA2YDR390C 1911 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 VTC2YFL004W 2487 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 DED81YHR019C 1665 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 RPP1AYDL081C 321 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 FMC1YIL098C 468 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 PAN6YIL145C 930 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 SSN8YNL025C 972 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 DCS2YOR173W 1062 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 HEM4YOR278W 828 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 TSC3YBR058C-A 243 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 SUL2YLR092W 2682 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 TRF5YNL299W 1929 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 SLK19YOR195W 2466 nt5.64□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 VTH1YIL173W 4650 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 VTH2YJL222W 4650 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 QDR1YIL120W 1692 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 ATH1YPR026W 3636 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 SUR2YDR297W 1050 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 RRD2YPL152W 1077 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 TPD3YAL016W 1908 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 PPZ1YML016C 2079 nt5.63□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 YCL065WYCL065W 369 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 HSP30YCR021C 999 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 LCL2YLR104W 396 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 PEX17YNL214W 600 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 ESF2YNR054C 951 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 snR42snR42 351 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 TRS65YGR166W 1683 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 YHR182WYHR182W 2358 nt5.62□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.61□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 OPI6YDL096C 327 nt5.61□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 UTR4YEL038W 684 nt5.61□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 CAJ1YER048C 1176 nt5.61□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 VHR2YER064C 1518 nt5.61□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 RAD3YER171W 2337 nt5.61□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 FRS2YFL022C 1512 nt5.61□□□□□ -1.51
TFB4Q12004 YPS5YGL259W 498 nt5.61□□□□□ -1.51
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