Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCBP1Q09161 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCBP1Q09161 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms