Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4CQ08493 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms