Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB2Q08289 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms