Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL16A1Q07092 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL16A1Q07092 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms