Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 TMA64YDR117C 1698 nt2.33□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 ORC2YBR060C 1863 nt2.33□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 DUN1YDL101C 1542 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 SIR3YLR442C 2937 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YCK2YNL154C 1641 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 LRS4YDR439W 1044 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 SMT3YDR510W 306 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 DOG1YHR044C 741 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 SNX4YJL036W 1272 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 IRC14YOR135C 342 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 MRP2YPR166C 348 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 LDH1YBR204C 1128 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 PBS2YJL128C 2007 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 PIN4YBL051C 2007 nt2.32□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YEF3YLR249W 3135 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YGR064WYGR064W 369 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YGR114CYGR114C 390 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 IMP3YHR148W 552 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 VMA5YKL080W 1179 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 RPS10BYMR230W 318 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YOR114WYOR114W 885 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 ATP3YBR039W 936 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 TIM12YBR091C 330 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 PKP2YGL059W 1476 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YGL176CYGL176C 1665 nt2.31□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YGR190CYGR190C 366 nt2.3□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YHR097CYHR097C 1101 nt2.3□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YLR042CYLR042C 486 nt2.3□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 AAH1YNL141W 1044 nt2.3□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 GCD10YNL062C 1437 nt2.3□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YJR061WYJR061W 2808 nt2.3□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 AI2Q0055 2565 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YDR535CYDR535C 501 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 THO1YER063W 657 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 PEX4YGR133W 552 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YIL024CYIL024C 570 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 ERG20YJL167W 1059 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YKL162CYKL162C 1209 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 RPL8BYLL045C 771 nt2.29□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 RLI1YDR091C 1827 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 SPH1YLR313C 1593 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YML096WYML096W 1578 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 RPS25AYGR027C 327 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 LAC1YKL008C 1257 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YKR070WYKR070W 1059 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YLL047WYLL047W 384 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 POP8YBL018C 402 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YNL234WYNL234W 1281 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 ATG5YPL149W 885 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 ORC1YML065W 2745 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YOL098CYOL098C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
NEJ1Q06148 YJL132WYJL132W 2253 nt2.28□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ITT1YML068W 1395 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 HTA1YDR225W 399 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 AIM11YER093C-A 414 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 FIP1YJR093C 984 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RNH203YLR154C 333 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 COX14YML129C 213 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YBL028CYBL028C 321 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SYC1YOR179C 567 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 DAD3YBR233W-A 285 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 PTP3YER075C 2787 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RIT1YMR283C 1542 nt2.27□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SNX41YDR425W 1878 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ECM18YDR125C 1362 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RNH202YDR279W 1053 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YGR039WYGR039W 312 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 OMA1YKR087C 1038 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 DUG3YNL191W 1074 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YOL166CYOL166C 339 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 snR11snR11 258 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 PFY1YOR122C 381 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RPS12YOR369C 432 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 STE11YLR362W 2154 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RSE1YML049C 4086 nt2.26□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SSN2YDR443C 4263 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RRI1YDL216C 1323 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 AIM6YDL237W 1173 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ERG25YGR060W 930 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RNR2YJL026W 1200 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SAW1YAL027W 786 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YOR050CYOR050C 348 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ARF3YOR094W 552 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 CAT5YOR125C 702 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RRD2YPL152W 1077 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ALG14YBR070C 714 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RRP7YCL031C 894 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 KAR5YMR065W 1515 nt2.25□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 IRA2YOL081W 9240 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 VPS64YDR200C 1815 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 KRE33YNL132W 3171 nt2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms