Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEUP1Q05D60 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms