Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TNP2Q05952 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TNP2Q05952 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms