Protein–RNA interactions for Protein: Q04461

YMR111C, Uncharacterized protein YMR111C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR111CQ04461 ERV1YGR029W 570 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YHL005CYHL005C 393 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 PFS1YHR185C 714 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 ICS2YBR157C 768 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RRP7YCL031C 894 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 HBT1YDL223C 3141 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RPA190YOR341W 4995 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 ESC1YMR219W 4977 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 TFC4YGR047C 3078 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 PMR1YGL167C 2853 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 MMS1YPR164W 4224 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YBR259WYBR259W 2067 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 POL3YDL102W 3294 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RGI2YIL057C 495 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RPA12YJR063W 378 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 PRM6YML047C 1059 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 ERV41YML067C 1059 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YMR087WYMR087W 855 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 TPT1YOL102C 693 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 SRL1YOR247W 633 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YPL107WYPL107W 747 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YIL169CYIL169C 2988 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RIF1YBR275C 5751 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 ECM21YBL101C 3354 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YCL019WYCL019W 5313 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 MAK5YBR142W 2322 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RGI1YER067W 486 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 TDA10YGR205W 873 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RIM9YMR063W 720 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 PIS1YPR113W 663 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 ERV15YBR210W 429 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 TLC1TLC1 1301 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 PSP1YDR505C 2526 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 POL4YCR014C 1749 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 TOP2YNL088W 4287 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 ECM29YHL030W 5607 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 FIR1YER032W 2631 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 VHR1YIL056W 1923 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 THP2YHR167W 786 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 PPX1YHR201C 1194 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 MCR1YKL150W 909 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 CDC123YLR215C 1083 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 RCE1YMR274C 948 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 ATG29YPL166W 642 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 PBP2YBR233W 1242 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR111CQ04461 SIR3YLR442C 2937 nt2.84□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 ICR1ICR1 3199 nt2.84□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YDR239CYDR239C 2364 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 CSF1YLR087C 8877 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 ERG11YHR007C 1593 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 UPF3YGR072W 1164 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 PDS5YMR076C 3834 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 PDR17YNL264C 1053 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 BAG7YOR134W 1230 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YPL216WYPL216W 3309 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YNL011CYNL011C 1335 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 NSA1YGL111W 1392 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 FRE8YLR047C 2061 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 RGC1YPR115W 3252 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 DYN1YKR054C 12279 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 BOI1YBL085W 2943 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 COBQ0105 1158 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 QCR10YHR001W-A 234 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 SDO1YLR022C 753 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 NNT1YLR285W 786 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YLR365WYLR365W 333 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 ILS1YBL076C 3219 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 PAM1YDR251W 2493 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 BI3Q0115 1554 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 SOK1YDR006C 2706 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YME2YMR302C 2553 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 SNU23YDL098C 585 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 RRT13YER066W 558 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YLL047WYLL047W 384 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 RIF2YLR453C 1188 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 GAB1YLR459W 1185 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 ATG16YMR159C 453 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 MPP6YNR024W 561 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 GRX7YBR014C 612 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YOR203WYOR203W 354 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 RPN8YOR261C 1017 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YOR385WYOR385W 873 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 RRD2YPL152W 1077 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 YDR131CYDR131C 1671 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR111CQ04461 CEP3YMR168C 1827 nt2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms