Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAP1Q03518 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms