Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
TOP2BQ02880 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms