Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NHLH2Q02577 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLH2Q02577 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms