Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN2Q02246 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms