Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 RIM13YMR154C 2184 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RRP42YDL111C 798 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 PCL2YDL127W 927 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RTT105YER104W 627 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 MSA2YKR077W 1092 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 USB1YLR132C 873 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YOR331CYOR331C 558 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RPS12YOR369C 432 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YPR078CYPR078C 1119 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 VPS64YDR200C 1815 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 DNL4YOR005C 2835 nt2.3□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 MPS1YDL028C 2295 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RSM23YGL129C 1353 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 MCM21YDR318W 1107 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 EDC1YGL222C 528 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SDO1YLR022C 753 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 PIN3YPR154W 648 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 APD1YBR151W 951 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 DSS1YMR287C 2910 nt2.29□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RSE1YML049C 4086 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 PLM2YDR501W 1566 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 JIP5YPR169W 1479 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SMX2YFL017W-A 234 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YGL101WYGL101W 648 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RNR2YJL026W 1200 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 ERV41YML067C 1059 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 HSP10YOR020C 321 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YPL276WYPL276W 438 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SSN2YDR443C 4263 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SUL1YBR294W 2580 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SIN3YOL004W 4611 nt2.28□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SIR3YLR442C 2937 nt2.28□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 ENP2YGR145W 2124 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 FIR1YER032W 2631 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 CWH41YGL027C 2502 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 SNX41YDR425W 1878 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 CTH1YDR151C 978 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YGR293CYGR293C 462 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 OTU2YHL013C 924 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 GPI14YJR013W 1212 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 LSM8YJR022W 330 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 PRE8YML092C 753 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 COS1YNL336W 1146 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 ATG34YOL083W 1239 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 snR34snR34 203 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 STE11YLR362W 2154 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 PHO2YDL106C 1680 nt2.27□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 GCD10YNL062C 1437 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 NMA111YNL123W 2994 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YGL176CYGL176C 1665 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 PBS2YJL128C 2007 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 IZH1YDR492W 951 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 DUO1YGL061C 744 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YGL218WYGL218W 651 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 PEX4YGR133W 552 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 PTI1YGR156W 1278 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 CIR1YGR207C 786 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 MRPL9YGR220C 810 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YHR097CYHR097C 1101 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YNR068CYNR068C 819 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 HRT1YOL133W 366 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 ATP3YBR039W 936 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 MSH4YFL003C 2637 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 HBT1YDL223C 3141 nt2.26□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 BOI1YBL085W 2943 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 snR63snR63 255 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 MED2YDL005C 1296 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YGL118CYGL118C 438 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 TAN1YGL232W 870 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 MRPL6YHR147C 645 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YKR070WYKR070W 1059 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 POS5YPL188W 1245 nt2.25□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 FAR11YNL127W 2862 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 RPN4YDL020C 1596 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 SAK1YER129W 3429 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 HMO1YDR174W 741 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YGL159WYGL159W 1113 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 ERG25YGR060W 930 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 PEX18YHR160C 852 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 DCG1YIR030C 735 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YLR290CYLR290C 834 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YMR187CYMR187C 1296 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YSF3YNL138W-A 258 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YOR050CYOR050C 348 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 ARF3YOR094W 552 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 FKS3YMR306W 5358 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 VPS13YLL040C 9435 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 TMA64YDR117C 1698 nt2.24□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 NSE3YDR288W 912 nt2.23□□□□□ -2.05
NUP49Q02199 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.23□□□□□ -2.05
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