Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BEX3Q00994 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms