Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP5P82980 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP5P82980 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP5P82980 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBP5P82980 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms