Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMF1P82094 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMF1P82094 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMF1P82094 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TMF1P82094 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMF1P82094 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMF1P82094 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMF1P82094 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMF1P82094 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMF1P82094 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMF1P82094 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMF1P82094 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMF1P82094 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMF1P82094 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms