Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP1P78357 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms