Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSNK2A1P68400 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms