Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL30P62888 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL30P62888 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL30P62888 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms