Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBX1P62877 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms