Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNB1P62873 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms