Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2NP61088 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2NP61088 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms