Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP11P59045 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRP11P59045 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms