Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3BP58499 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms