Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP7P55210 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP7P55210 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP7P55210 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP7P55210 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP7P55210 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP7P55210 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP7P55210 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP7P55210 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms