Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC4P55056 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC4P55056 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC4P55056 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.2 ms