Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEMP55040 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEMP55040 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEMP55040 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GEMP55040 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEMP55040 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GEMP55040 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEMP55040 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEMP55040 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEMP55040 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms