Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D1P54289 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms