Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACLYP53396 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACLYP53396 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACLYP53396 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACLYP53396 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACLYP53396 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACLYP53396 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACLYP53396 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACLYP53396 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACLYP53396 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACLYP53396 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACLYP53396 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACLYP53396 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms