Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE6CP51160 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms