Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXNP49023 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXNP49023 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXNP49023 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXNP49023 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXNP49023 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXNP49023 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms