Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms