Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDO2P48775 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDO2P48775 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDO2P48775 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TDO2P48775 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDO2P48775 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDO2P48775 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDO2P48775 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDO2P48775 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms