Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC10P48553 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms