Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms