Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms