Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL35P42766 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL35P42766 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL35P42766 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL35P42766 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL35P42766 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms