Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH1P40925 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH1P40925 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms